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為提升花東地區的產業水準以及滿足經理人充實管理專業知識之需求，於⺠國 93 年設立『高階經營管理碩士在職專班』(簡稱高階 EMBA 班)，於96學年度起，設立執行長一職由管院教授兼任,負責本專班之班務經營。本專班在層級上不同於本校管理學院其他系設之在職專班，為唯一直屬於管理學院轄下之專班，以院層級之定位提供豐富的軟硬體資源及跨系所優良師資，為學員營造全院最優質的學習環境。